千年一次的彗星之夜里，愿望将会实现…… 立志成为出色的神奇宝贝训练师的小智、小遥和小胜，带着皮卡丘展开了新的旅程。为了观看千年彗星出现的刹那，来到恩斯游乐场，并认识魔术师巴特勒与戴安。在魔术表演中，小胜听到一阵细微的呼唤声… 那是在〝沉眠之茧〞中沉睡了千年，可帮助人类达成愿望的神奇宝贝——基拉祈。在千年彗星出现的夜晚，如果遇到拥有纯真心灵的伙伴便会苏醒。为了让基拉祈醒来，巴特勒请小胜当基拉祈的伙伴，果然，基拉祈从万花镜般的光芒中苏醒过来。 虽然基拉祈只能停留短暂的七日就会再消失，但是头一次拥有属于自己的神奇宝贝的小胜，对基拉祈却非常宠爱。充满野心的魔术师巴特勒，因为知道基拉祈具有神奇的力量，便把基拉祈给抢走，并且想利用他来完成愿望。 不怀好意的巴特勒，他的愿望是什么呢？小智与小胜要如何克服困难，成功救出同伴呢？小胜与基拉祈又会面临怎样的生离死别呢？
演员：汤姆·汉克斯 蒂姆·艾伦 唐·里克斯 吉姆·法尼 华莱士·肖恩 约翰·拉岑贝格 安妮·波茨 约翰·莫里斯 伊瑞克·冯·迪滕 劳里·梅特卡夫 李·厄米 佩恩·吉列特 杰克·安杰尔 黛比·德里贝里 比尔·法玛尔 雪莉·琳恩 斯科特·麦克菲 米凯·麦高万 杰夫·皮金 菲尔·普洛克特 扬·拉布森 乔·兰福特 安德鲁·斯坦顿 内森·连恩 约翰·拉塞特 卢卡·佩洛斯 埃林·萨贝拉
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