公元1633年，大明水师最年轻旗总路长风护送东厂督公下南洋缉拿要犯，遭遇海兽舰队袭击，全军覆没。路长风被一神秘组织所救，随之来到大航海时代国际贸易中心-吕宋岛。岛民们在大明奇人宋应醒的引领下，建立世界融合城市“万国”，反抗西班牙殖民者的残酷统治。